Młody trener Pokemonów zbiera pozostałe odznaki uprawniające go do wzięcia udziału w miejscowej Lidze, stacza wiele walk ze swoimi rywalami, poznaje nowych przyjaciół, łapie nowe stworki oraz musi stawić czoła groźniejszemu niż kiedykolwiek wcześniej Zespołowi R.
W podróży towarzyszą mu Iris, młoda trenerka smoczych Pokemonów oraz Cilan, znawca Pokemonów klasy A.