Apolonia jest opowieścią o dorastaniu i egzystencjalną podróżą do umysłu młodej kobiety - jej przekonań o seksualności, sztuce, ideałach i miłości oraz o tym, jak ich doświadczała i jak się zmieniały. W filmie podążamy za Apolonią Sokół, która opuszcza Danię i przeprowadza się do swojego rodzinnego miasta, Paryża, by tam zostać malarką. To droga osobistego i artystycznego rozwoju francusko-polskiej malarki: od dojrzewania talentu aż po przejście na komercyjną stronę świata artystycznego.