Po zwycięstwie nad złym czarownikiem mistrzowie zaatakowani zostają przez Hao-Kahna (Brian Thompson), imperatora Zaświatów. Johnny Cage (Chris Conrad) ginie. Raiden (James Remar), bóg światła i gromu, wyjaśnia Liu (Robin Shou) oraz jego towarzyszom, że Shao-Kahn zdecydował się odrzucić reguły Mortal Kombat i zaprowadzić piekło na ziemi, pomagając siłom Innego Wymiaru przeniknąć do świata ludzi.