W "The Suffering 2" ponownie obejmujemy kontrolę nad szaleńcem Torque, a główny wątek fabularny kontynuacji rozpoczyna się w momencie, gdy końca dobiegła historia części pierwszej. Torque, skazaniec oskarżony o zamordowanie żony Carmen i dzieci, musi oczyścić się z zarzutów, a naszym zadaniem jest mu to ułatwić. Warto zaznaczyć, że dużą rolę w drugiej części "The Suffering" odgrywa rzekomo zamordowana Carmen. Oprócz niej Torque napotyka na swej drodze takie postaci, jak Doktor Killjoy lub Jordan, pani prezes zajmująca się badaniami nad morderczymi kreaturami zamieszkującymi świat gry.