W 200 lat po śmierci Ripley na Fiori 161, grupa naukowców wojskowych posiadająca próbkę krwi Ripley, klonuje ją w celu wydobycia obcego z jej ciała. Ku ich zdumieniu jeden z klonów przeżywa operację i ma się dobrze. Pozostawiają ją z czystej ciekawości. tymczasem do statku wojskowego przybywa statek kosmiczny Betty wraz z żywym załadunkiem. Sprytni Obcy wydostają się z zamkniętych pomieszczeń i rozchodzą się po całym statku zabijając wszystko po drodze. Załoga statku Betty próbuje znaleźć wyjście, z pomocą przychodzi im Ripley. Z upływem czasu Ripley odkrywa prawdziwy cel swojego klonowania.