Rząd amerykański otrzymuje informacje o pojawieniu się tajemniczego potwora morskiego. W celu zbadania sprawy zostaje wysłany okręt Abraham Lincoln. Okręt podczas misji zostaje staranowany i zatopiony przez potwora. Stwór okazuje się być okrętem podwodnym zbudowanym przez muzułmańskiego księcia Daakera. Daaker ściga brytyjskiego kupca Charlesa Denvera, który spowodował śmierć jego żony i porwał jego dziecko. Książę Daaker, teraz nazywający siebie kapitanem Nemo, bierze na pokład trójkę ocalałych pasażerów Abrahama Lincolna.