Bernardyn Beethoven mieszka z rodziną Newtonów, która nie wyobraża sobie już życia bez swojego pupila. Pewnego dnia zakochuje się on w suczce Missy. Dzieci Newtonów są zaniepokojone zmianą zachowania ich psa. Postanawiają go śledzić. Szybko odkrywają, że Beethoven i jego wybranka mają szczenięta. Niestety, okazuje się, że właścicielka Missy, bezwzględna Regina (Debi Mazar), zamierza sprzedać małe pieski. Do akcji wkraczają dzieci Newtonów i sam Beethoven.