Fabuła tego filmu skupia się w okół małego i niepozornego Pokémona - Celebi, który jest nielada kąskiem dla kłusowników i kolekcjonerów. Przekonuje się o tym także młody trener Sammy, który ratuje Stworka przed zagrożeniem. Niestety, Trawiasty Pok instynktownie używa swych mocy, przenosząc się w przyszłość, razem ze swym wybawcą.Czterdzieści lat później Sammy poznaje Asha, Misty i Brocka, z którymi próbuje odszukać Mistycznego Stworka.